Kard. Józef Glemp jest doktorem honoris causa następujących wyższych uczelni: Akademii Teologii Katolickiej w Warszawie (1982), Villanova University w Filadelfii (1985), Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego (1985), University of Santo Tomas w Manili na Filipinach (1988), Università degli Studi di Bari we Włoszech (1990), Seton Hall University w South Orange NY w USA (1991), Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie (1992), Papieskiego Wydziału Teologicznego w Warszawie (1995), Loyola University w Chicago (1998) i Uniwersytetu Kardynała Stefana Wyszyńskiego w Warszawie (2001).
Otrzymał także godność baliwa wielkiego krzyża honoru i dewocji Suwerennego Rycerskiego Zakonu Szpitalników Świętego Jana Jerozolimskiego, zwanego Maltańskim (1994) i pełni funkcję wielkiego przeora Zwierzchnictwa Polskiego Zakonu Rycerskiego Grobu Bożego w Jerozolimie (od 1996).
Posiada honorowe obywatelstwo wielu miast, m.in. Warszawy, Inowrocławia, Mogilna, Żnina, Darłowa, Miechowa, Piastowa, Łowicza, Pakości, Skierniewic, Gminy Kampinos oraz Castel Sant`Elia i Codroipo we Włoszech.
Otrzymał wiele nagród i odznaczeń, wśród nich: Premio della Pace – przyznaną przez Centro Culturale S.S. Croce (Taranto 1982); Premio della Pace „Giorgio La Pira” (Pistoia 2000) – w uznaniu dla postawy w czasie stanu wojennego w Polsce; Statuetkę „Złotego Hipolita” i Godność „Wybitnej Osobistości Pracy Organicznej” – przyznane przez Towarzystwo im. Hipolita Cegielskiego; Nagrodę „Oskar Polskiego Biznesu”; Nagrodę Fundacji „Solidarna Wieś” im. Bpa R. Andrzejewskiego (2006); Medal Milito pro Christo i Dyplom Benemerenti Ordynariatu Polowego Wojska Polskiego (2008); Nagrodę za szczególne zasługi dla KUL „Deo et Patriae deditus”; Nagrodę Honorową TVP Polonia „Za zasługi dla Polski i Polaków poza granicami kraju”; Nagrodę Sursum Corda Tygodnika Katolickiego „Niedziela”; Wawrzyn Polonijny – najwyższe odznaczenie przyznawane przez Stowarzyszenie „Wspólnota Polska”; Medal Senatu RP za zasługi dla Polonii; Medal Gloriam Dei Cantare za zasługi dla Federacji Caecilianum; Order Świętej Wiktorii – przyznawany przez Biskupa Łowickiego (2009); Medal Casimirus Magnus – przyznany przez Senat Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy; „Złoty Laur Samorządowy” – przyznany przez Gminę Nadarzyn (2009); Medal „Fidelitas” za zasługi dla Polonii – przyznawany przez Szkoły w Orchard Lake (2010); Medal Instytutu Agronomicznego w Marymoncie – przyznawany przez Szkołę Główną Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie (2010); Medal Alma Mater Benemerentibus – przyznawany przez Kapitułę Politechniki Warszawskiej (2010).
